杭州儿童医院占地面积18800平方米，设20个病区，开放床位800张，拥有职工约1200人，其中副高以上职称175人；拥有博士研究生导师10名，硕士研究生导师35名。医院年门诊量约120余万人次，年收治急诊病人20余万人次，急诊抢救成功率达99%；年接收住院患儿达3万人次；年手术量逾12000余台（门诊和住院合计）。
经过五十余年的精心建设，特别是近几年的快速发展，杭州儿童医院积聚了较为雄厚的学科和临床技术力量，打造了一批在全国处于领先或先进地位的专业，其中新生儿专业、小儿消化专业均达到国内领先水平，小儿心血管专业、小儿血液及肿瘤专业及儿童保健专业处于国内先进行列。
杭州儿童医院是浙江省新生儿疾病防治中心、浙江省小儿心血管疾病防治中心、浙江省新生儿疾病筛查中心、浙江省基因诊断中心和浙江省听力筛查管理中心所在地，同时也是浙江大学医学院儿科研究所所在地、儿科学硕士学位授予点（国务院首批批准）、博士学位授予点、博士后流动站。医院儿科学先后被批准为浙江省重点学科、浙江大学“985工程”重点建设学科，重点学科。医院PCR实验室通过国家卫生部认证，为卫生部示范实验室。
杭州儿童医院创办的《World Journal of Pediatrics》是我国儿科学领域中单一以全英文发表原创性论文的国际性学术期刊，为国际间儿科学术交流提供了有效平台，现杂志已被《Chemical Abstract Service》收录，并开通了杂志网络版（ www.wjpch.com）。另外，医院设有儿科教研室，承担了浙江大学医学院临床医学各专业的儿科学教学任务，为国家培养了大批医学人材。医院还积极开展国际交流，先后与联合国儿童基金会、世界卫生组织、世界人口基金会、美国国立卫生研究院等国际组织开展合作交流，并与美国、英国、加拿大、日本、德国、比利时等十多个国家建立了学术交流与合作关系。